机械工程学科为浙江省“十三·五”浙江省一流学科，其支撑的机械设计制造及其自动化专业为国家一流本科专业，2020年通过工程教育认证。建有浙江省海洋渔业装备技术研究重点实验室等相关平台，学位点为全国农林海洋高校研究生教育水产渔业协作组组长单位和舟山市国家渔业科技装备创新联合会副会长单位。学位点现有国家WRJH科技创新领军人才、浙江省“新世纪151人才工程”第一层次1人，国家海外高层次引才计划1人，省高校中青年学科带头人2人，省151人才工程3人。
机械工程学科一级学科主要围绕海洋/渔业机电装备、涉海智能制造、临港装备运维产业发展需要，对机械制造及其自动化、机械电子工程、机械设计与理论、低空技术与工程等领域开展研究。
（一）机械制造及其自动化
本学科方向主要以数字化设计与制造技术、临港工业装备制造与维护研究为主。
1.数字化设计与制造技术
主要围绕通用机械、塑机螺杆、汽配航空等地方产业生产制造过程中存在的科学技术问题，同时开展智能制造、绿色制造、3D 打印、集成制造、互联网+、大数据等先进制造技术研究。
2.临港工业装备制造与维护
主要围绕船舶修造、临港机械、渔业捕捞、养殖装备、水产品加工等领域科学技术问题，同时开展装备研发与制造技术研究。
（二）机械电子工程
本学科方向主要以机电设备智能控制、海洋电子与渔业机械仪器研究为主。
1.机电设备智能控制
主要围绕机电装备升级换代、智能制造等现有装备技术提升改造过程中存在的科学技术问题，同时开展涉海机电产品自动化控制、机器人运动控制、水下机器人技术、机电产品智能检测技术研究。
2.海洋电子与渔业机械仪器
主要围绕渔业捕捞、养殖装备、海洋机械电子等领域信息化、智能化方面的科学技术问题，同时开展海洋通讯技术、GPS、惯性导航、无线传感器技术、渔业电子仪器等方面的研究。
（三）机械设计与理论
本学科方向主要以渔业机械设计与理论、涉海机械装备工程材料与防护研究为主。
1.渔业机械设计与理论
主要围绕渔船及装备，渔业捕捞、海水养殖和水产品加工机械等渔业装备的总体设计、结构优化、动力及工程分析、自动控制策略等设计过程中存在的科学技术问题，同时开展渔业装备设计、设备监测与控制、可靠性全寿命风险评估与决策、渔船设备振动与噪声等研究。
2.涉海机械装备工程材料与防护
主要围绕海洋工程装备、渔业船舶、渔业装备等机械装备磨损、海洋工程防污防护、海洋工程腐蚀在线监测与修复等科学技术问题，同时开展表面工程及摩擦学、金属材料、3D金属打印材料特性与材料保护、海洋光电功能材料等研究。
（四）低空技术与工程
本学科方向主要以飞行器的智能控制、通讯、导航等研究为主。
1.海域低空飞行器智能自主技术
围绕高精度感知与全流程智能控制，通过多源融合导航、高动态授时与智能协同定位，为系统提供鲁棒的时空基准；并基于此深度集成自主决策、分布式协同控制及高容错系统，实现从复杂环境感知到全流程自主作业的闭环，保障飞行器在海域低空高效、可靠运行。
2.海域低空智能通信与网络
围绕低空动态环境下飞行器与地面站、卫星及其他飞行器之间的高效、可靠、安全的通信与组网技术，研究海域低空信道建模、专用通信协议、多智能体协同组网、空天地海一体化网络架构及智能频谱管理等。通过通信-感知-控制一体化技术，解决高机动性链路不稳、三维空间信号遮蔽等低空通信特有挑战，以满足高可靠、实时传输的严苛要求，为规模化低空应用提供网络支撑。
